长沙质量对样本进行宏病毒组测序服务为先

时间:2020年04月15日 来源:

哪些应用场景会对样本进行宏病毒组测序?

宏病毒组其实就是病毒的宏基因组(meta-genomics),该技术是随着高通量测序技术的兴起而发展起来的。该技术主要是使用大量微生物群体样本的测序数据和生物信息学分析手段,以多种数据库为基础,进行群体的种类和功能分析。因此,它主要的应用场景在于微生物群体研究,如肠道微生物、皮肤微生物、口腔微生物、水体微生物、土壤微生物等。一直以来宏基因组技术都是在细菌领域使用,病毒的样本收集困难、文库构建繁琐、数据库不完善,因此宏基因组技术未能获得广泛应用。上海探普生物科技有限公司立志专门解决病毒方向的基因组研究难题,开发了整套的样本处理和生信分析流程,基于这套流程,研究者们想对样本进行宏病毒组测序就很容易实现了。


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在探普生物进行病毒宏基因组测序,样品具备什么条件才可以获得比较质量的宏基因组分析效果?

其他公司对用于测序的样本的要求较高。而在探普生物进行病毒宏基因组测序,基于探普的专有流程,样本要求非常低,不要求总量到达微克,探普有专门的收样标准和送样流程。为了保证后续数据的有效利用率,需要客户配合完成合格的取样步骤和样本前处理步骤。当然探普也提供适当的样本处理服务。核酸性质有RNA和DNA之分,核酸链还有单双链之分,而核酸本质不同和单双链的不同,进行同样的实验步骤其效率也不一样。这些特点决定了宏基因组测序是相对个性化定制化的一类服务,出于对结果真实性的尊重和保证,需要客户和销售人员充分沟通,设定合理的样本处理方案。


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上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序以后的数据分析是如何进行的?

寄生性质的生物下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点,优化了自有数据库,搭载了**的生物信息学分析流程,可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括,1,基于数据库,去除宿主数据和其他微生物数据,筛选出目的序列,然后进行序列组装,物种分类,丰度统计。样本数量达到一定标准还可以进行差异分析。现有数据库不够完善,出于对数据真实性的尊重,探普生物一般不进行功能相关的分析。预测性质的分析可以根据具体项目评估数据库质量后进行。


在探普生物进行病毒宏基因组测序流程是怎么样的?

在探普生物进行病毒宏基因组测序的流程非常简单,简而言之,客户只需要说清楚样品情况,准备样品即可,其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下:

1)与销售人员沟通项目需求和样本情况;

2)探普生物工作人员拟定项目合同,双方协商合同内容后签字盖章;

3)按样本准备指南准备好样本,填写信息单后通知销售人员预订干冰,安排样本寄运输;

4)客户支付项目启动款,探普生物启动项目实验和分析并提供测序报告;

5)客户支付项目尾款,探普生物提交测序数据和分析结果;

6)售后问题处理,项目结题。


上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序实验是如何进行的?

探普生物对样本进行宏病毒组测序实验基于二代测序技术。经过核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这3大基本流程后,样本转换成了序列数据。首先,在核酸纯化环节,探普提供专门针对病毒的核酸纯化样本指南,以提高纯度和得率,与此同时探普生物也提供核酸纯化服务。第二,文库构建环节。样本的核酸具备浓度低,总量少的特点。探普生物专门针对这一点开发了超微量核酸文库构建,可以将0.01ng/μl甚至更低浓度的核酸构建成测序文库。第三,生物信息学分析环节。寄生性质的生物下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点,优化了自有数据库,搭载了**的生物信息学分析流程,可处理复杂背景下的目标物种序列。


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上海探普生物科技有限公司于2018-10-30成立,注册资本300-500万元元,现有专业技术人员5~10人人,各种专业人员齐备。专业的团队大多数员工都有多年工作经验,熟悉行业专业知识技能,致力于发展探普的品牌。公司以用心服务为**价值,希望通过我们的专业水平和不懈努力,将从事生物科技专业领域内技术开发、技术转让、技术咨询、技术服务,化工原料及产品(除危险化学品、监控化学品、烟花爆竹、民用物品、易制毒化学品),实验室设备,医疗器械(***不需医疗器械许可证的品种),计算机、软件及辅助设备,电子产品销售,计算机软件开发及维护,计算机信息系统集成服务等。等业务进行到底。探普生物始终以质量为发展,把顾客的满意作为公司发展的动力,致力于为顾客带来***的[ "病毒测序", "病毒全基因组测序", "病毒宏基因组测序", "未知病原鉴定" ]。

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